Edge of Insanity, l'un de ses douze albums solo, est toujours considéré comme l'un des dix meilleurs albums de guitare de tous les temps. En plus de son travail solo, Tony a également fait partie de plusieurs groupes de rock dont Planet X avec Derek Sherinian et Virgil Donati, PSMS (Portnoy / Sheehan / MacAlpine / Sherinian), ainsi que le CAB nominé aux Grammy avec le bassiste Bunny Brunel et le batteur Dennis Chambers.
MacAlpine a également passé sept ans comme guitariste et clavieriste dans le groupe de tournée de Steve Vai.